Skip to main content

Table 2 Differences among representatives of the genera Brachiola, Glugea, Loma, Microgemma and Pleistophora for 16S rDNA sequences, pairwise nucleotide differences (above the diagonal) and p-distances (below the diagonal) 774 bp sequences

From: A severe microsporidian disease in cultured Atlantic Bluefin Tuna (Thunnus thynnus)

 

Species

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

1

Brachiola algerae

206

197

205

200

200

204

205

197

198

204

210

197

205

205

211

213

212

191

188

206

216

210

2

Glugea anomala

0.315

60

2

58

62

2

2

61

62

1

18

61

4

2

103

89

91

108

118

75

71

78

3

Glugea arabica

0.302

0.090

58

4

3

58

58

1

1

59

69

1

60

58

106

97

97

117

113

72

70

73

4

Glugea atherinae

0.313

0.003

0.086

56

60

0

0

59

60

1

16

59

2

0

101

87

89

107

116

74

70

77

5

Glugea eda

0.306

0.087

0.006

0.083

5

56

56

5

5

57

67

5

58

56

107

97

97

118

116

70

72

71

6

Glugea epinephelusis

0.306

0.093

0.004

0.089

0.007

60

60

4

4

61

71

4

62

60

110

100

100

120

117

74

74

75

7

Glugea gasterostei

0.311

0.003

0.087

0.000

0.083

0.089

0

59

60

1

16

59

2

0

101

87

89

106

115

74

70

77

8

Glugea hertwigi

0.313

0.003

0.086

0.000

0.083

0.089

0.000

59

60

1

16

59

2

0

101

87

89

107

116

74

70

77

9

Glugea jazanensis

0.301

0.091

0.001

0.088

0.007

0.006

0.088

0.088

2

60

70

2

61

59

107

97

97

118

114

71

72

72

10

Glugea nagelia

0.303

0.093

0.001

0.089

0.007

0.006

0.089

0.089

0.003

61

71

2

62

60

108

98

98

119

115

73

72

74

11

Glugea plecoglossi

0.311

0.001

0.088

0.001

0.085

0.091

0.001

0.001

0.089

0.091

17

60

3

1

102

88

90

107

116

73

71

77

12

Glugea sardinellensis

0.325

0.027

0.105

0.024

0.101

0.107

0.024

0.024

0.106

0.107

0.026

70

18

16

113

100

101

118

126

84

82

88

13

Glugea serranus

0.301

0.091

0.001

0.088

0.007

0.006

0.088

0.088

0.003

0.003

0.089

0.106

61

59

108

98

98

118

114

72

71

73

14

Glugea stephani

0.313

0.006

0.089

0.003

0.086

0.092

0.003

0.003

0.091

0.092

0.004

0.027

0.091

2

103

89

91

109

118

76

72

79

15

Glugea thunni sp. nov

0.313

0.003

0.086

0.000

0.083

0.089

0.000

0.000

0.088

0.089

0.001

0.024

0.088

0.003

101

87

89

107

116

74

70

77

16

Loma embiotocia

0.322

0.154

0.158

0.150

0.159

0.164

0.150

0.150

0.159

0.161

0.152

0.171

0.161

0.153

0.150

20

13

142

140

123

123

128

17

Loma morhua

0.325

0.133

0.145

0.129

0.145

0.149

0.129

0.129

0.145

0.146

0.131

0.151

0.146

0.132

0.129

0.030

7

131

131

115

112

119

18

Loma salmonae

0.324

0.136

0.145

0.132

0.145

0.149

0.133

0.132

0.154

0.146

0.134

0.153

0.146

0.135

0.132

0.019

0.010

134

132

113

112

117

19

Microgemma caulleryi*

0.307

0.169

0.184

0.167

0.185

0.188

0.166

0.167

0.185

0.187

0.167

0.188

0.185

0.170

0.167

0.222

0.205

0.210

50

120

115

124

20

Microgemma sp. partial 16S

0.298

0.182

0.175

0.179

0.179

0.181

0.177

0.179

0.176

0.177

0.179

0.197

0.176

0.182

0.179

0.216

0.202

0.204

0.079

128

118

128

21

Pleistophora ehrenbaumi

0.319

0.113

0.109

0.112

0.106

0.112

0.112

0.112

0.107

0.110

0.11

0.129

0.109

0.115

0.112

0.186

0.173

0.171

0.190

0.200

53

56

22

Pleistophora mirandellae

0.331

0.106

0.105

0.104

0.108

0.111

0.104

0.104

0.108

0.108

0.106

0.124

0.106

0.107

0.104

0.184

0.167

0.167

0.180

0.182

0.080

5

23

Pleistophora typicalis

0.323

0.117

0.110

0.115

0.106

0.112

0.115

0.115

0.108

0.111

0.115

0.134

0.109

0.118

0.115

0.192

0.178

0.175

0.195

0.198

0.084

0.008

  1. *Accepted as Glugea microspora inLom (2002)