Colletotrichum caudatum s.l. is a species complex

Crouch, Jo Anne

doi:10.5598/imafungus.2014.05.01.03

IMA Fungus

Table 3 Comparison of delta and Q-residual scores for Colletotrichum taxa in the Caudatum subaggregate across four single-locus and combined nucleotide sequence datasets. Scores range from 0 to 1, where 0=tree-like data (additive) and 1=non-tree-like. Scores that depart from the mean score by >1 standard deviation are highlighted in grey.

From: Colletotrichum caudatum s.l. is a species complex

Strain no.	*Apn2*		ITS		Mat1/Apn2		*Sod2*		Combined
Strain no.	Delta score	Q-residual score	Delta score	Q-residual score	Delta score	Q-residual score	Delta score	Q-residual score	Delta score	Q-residual score
IMI 176617	0.16	0.014	0.126	0.006	0.159	0.056	0.09	0.005	0.175	0.026
IMI 176619	0.178	0.016	0.146	0.01	0.202	0.057	0.112	0.007	0.213	0.029
CBS113172	0.251	0.045	0.152	0.017	0.349	0.149	0.139	0.004	0.355	0.071
NY07-CC04	0.222	0.054	0.062	0.004	0.269	0.099	0.221	0.004	0.274	0.041
JAC 11–10	0.118	0.017	0.053	0.004	0.143	0.067	0.072	0.002	0.142	0.028
JAC 11–11	0.118	0.017	0.053	0.004	0.143	0.067	0.072	0.002	0.142	0.028
JAC 11–13	0.118	0.017	0.053	0.004	0.143	0.067	0.072	0.002	0.142	0.028
JAC 11–14	0.118	0.017	0.053	0.004	0.143	0.067	0.072	0.002	0.142	0.028
JAC 11–15	0.118	0.017	0.053	0.004	0.143	0.067	0.072	0.002	0.142	0.028
MAFF238573	0.197	0.027	0.056	0.004	0.127	0.059	0.07	0.002	0.167	0.024
MAFF238574	0.115	0.017	0.056	0.004	0.127	0.059	0.065	0.002	0.152	0.025
MAFF238575	0.115	0.017	0.056	0.004	0.127	0.059	0.065	0.002	0.152	0.025
MAFF238576	0.115	0.017	0.056	0.004	0.127	0.059	0.065	0.002	0.154	0.025
MAFF238577	0.123	0.02	0.056	0.004	0.127	0.059	0.07	0.002	0.149	0.025
MAFF305700	0.131	0.016	0.088	0.009	0.2	0.075	0.072	0.003	0.271	0.053
SD11	0.288	0.04	0.05	0.004	0.215	0.082	0.062	0.001	0.237	0.038
SD2	0.184	0.017	0.05	0.004	0.215	0.082	0.062	0.001	0.227	0.038
SD3	0.184	0.017	0.05	0.004	0.283	0.147	0.062	0.001	0.231	0.047
SD6	0.249	0.032	0.05	0.004	0.283	0.147	0.062	0.001	0.238	0.051
SD7	0.166	0.019	0.05	0.004	0.215	0.082	0.062	0.001	0.217	0.036
SD9	0.166	0.019	0.05	0.004	0.215	0.082	0.062	0.001	0.217	0.036
Mean	0.164	0.022	0.067	0.005	0.188	0.08	0.081	0.002	0.197	0.035
Standard deviation	0.053	0.011	0.032	0.003	0.065	0.03	0.037	0.001	0.058	0.012

Back to article page

ISSN: 2210-6359

Contact us

Submission enquiries: Access here and click Contact Us
General enquiries: info@biomedcentral.com